Στο Τμήμα λειτουργούν 3 προγράμματα μεταπτυχιακών σπουδών (ΠΜΣ):

  • Το ΠΜΣ «Μεταφραστική Έρευνα στη Βιοϊατρική»
  • Το ΠΜΣ «Η Διδακτική των Βιοεπιστημών»
  • Το ΠΜΣ «Εφαρμοσμένη Βιοπληροφορική και Ανάλυση Δεδομένων».

Επίσης στο Τμήμα λειτουργεί σε συνεργασία με το Τμήμα Ιατρικής το διατμηματικό:

  • ΠΜΣ «Λοιμώδη Νοσήματα-Διεθνής Ιατρική: από το εργαστήριο στην κλινική πράξη».