Σύντομη περιγραφή

Η ερευνητική μας ομάδα στο ΤΜΒΓ μελετά τη ρύθμιση της κυτταρικής διαίρεσης, ανευπλοειδίας και καρκινογένεσης, με ιδιαίτερη έμφαση στο ρόλο των μιτωτικών πρωτεϊνών ως προγνωστικών βιοδεικτών. Επιπλέον, εξετάζει την ανταπόκριση των μιτωτικών κυττάρων στη δράση μικρομοριακών αναστολέων και νανοφορέων αντικαρκινικών φαρμάκων. Παράλληλα, αναπτύσσει 3D πολυκυτταρικά σφαιροειδή που αναπαράγουν πιστότερα την αρχιτεκτονική των ιστών, τις διακυτταρικές συνδέσεις και τη λειτουργία του όγκου στα πρώιμα στάδια ανάπτυξής του.

Συνεργασίες & Τεχνολογίες Ανάπτυξης: Βιομηχανικές Συνεργασίες (Evrogen JSC, Marinpharm GmbH, PHARMATHEN SA): Ανάπτυξη προηγμένων φθοριζόντων μορίων και υβριδικών φθοριζόντων συμπλόκων με πρωτεΐνες, για μελέτη της ογκογένεσης, πρόσληψης και ενδοκυττάριας μεταφοράς φαρμάκων σε ζωντανά καρκινικά κύτταρα.

Διεπιστημονικές Συνεργασίες: Χρόνια Φλεγμονή & Ανοσοΐνωση (συνεργασία με Τμήμα Ιατρικής ΔΠΘ – ομάδες Ρίτη, Σκένδρου, Μητρούλη): Μελέτη των κυτταρικών και μοριακών μηχανισμών που ρυθμίζουν τη χρόνια φλεγμονή και την ανοσοϊνωτική εξέλιξη (immunofibrosis) σε κρίσιμες ανοσολογικές καταστάσεις, συμπεριλαμβανομένων σακχαρώδη διαβήτη τύπου 2, νόσου Crohn, ρευματοειδούς αρθρίτιδας COVID-19, και άλλες ασθένειες. Ιδιαίτερη έμφαση δίνεται στον ρόλο των εξωκυττάριων παγίδων ουδετερόφιλων (NETs), στην αλληλεπίδραση ουδετερόφιλων-ινοβλαστών και στο φαινόμενο της ανοσοθρόμβωσης (immunothrombosis).

Οστεοαρθρίτιδα (συνεργασία με Τμήμα Ιατρικής ΔΠΘ – ομάδες Δρόσου, Τιλκερίδη): Ανακάλυψη νέων θεραπευτικών στόχων και βιοδεικτών για τη θεραπεία και πρόληψη της νόσου. Χημική βιολογία και Σχεδιασμός φαρμάκων

  • Φωτοθερμικοί νανοράβδοι (συνεργασία με Τμήμα Φαρμακολογίας Παν. Πατρών – ομάδα Αυγουστάκη): Ανάπτυξη νανοράβδων χρυσού φορτωμένων με αντικαρκινικά φάρμακα για συνδυασμένη θεραπεία.
  • Σχεδιασμός αντικαρκινικών ενώσεων (συνεργασία με Τμήμα Χημείας ΑΠΘ – ομάδα Φυλακτακίδου): Συνδυασμός οργανικής χημείας, μοριακής μοντελοποίησης (molecular docking) και κυτταρικής βιολογίας για ανάπτυξη νέων θεραπευτικών προσεγγίσεων

Μέθοδοι & Υποδομές

  • Συνδυασμός μοριακής βιολογίας με προηγμένη απεικόνιση (SPIM, spinning disk confocal, SIM)
  • Τεχνικές φωτοενεργοποίησης και φωτοαποχρωματισμού για λειτουργικές αναλύσεις
  • Μοριακή μοντελοποίηση και ανάλυση εικόνας

Το εργαστήριο λειτουργεί τη Μονάδα Βιοαπεικόνισης του ΔΠΘ (open access facility) από το 2010, αποτελώντας κόμβο της εθνικής ερευνητικής υποδομής BioImaging-GR.

  • Ρύθμιση κυτταρικής διαίρεσης, ανευπλοειδίας και καρκίνου
  • Βιοδείκτες στην παθογένεια της φλεγμονής και του καρκίνου
  • Ο ρόλος των εξωκυττάριων παγίδων ουδετερόφιλων (NETs) στην παθοφυσιολογία αυτοάνοσων και χρόνιων νοσημάτων
  • Νανοφορείς ως συστήματα επιλεκτικής χορήγησης φαρμάκων
  • Οπτική βιοαπεικόνιση για τη μελέτη σφαιροειδών και οργανοειδών, απεικόνιση ζωντανών κυττάρων, ανάλυση εικόνας και in silico μοντελοποίηση

Υπεύθυνη της μονάδας Βιοαπεικόνισης  (BioImaging facility), Τμήμα Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής, Δ.Π.Θ. (2009-σήμερα)

  1. Επιστημονική  Υπεύθυνη του έργου με τίτλο «InTechThrace: Integrated Technologies in biomedical research: multilevel biomarker analysis in Thrace, Ενοποίησητεχνολογιών για βιοϊατρική έρευνα: ανάλυση βιοδεικτών σε πολλαπλά επίπεδα στηΘράκη» (MIS 5047285). Ακρωνύμιο: InTechThrace. Δράση ΥΠΟΣΤΗΡΙΞΗ ΤΗΣ ΠΕΡΙΦΕΡΕΙΑΚΗΣ ΑΡΙΣΤΕΙΑΣ Συγχρηματοδοτούμενα Έργα, Ε.Π. ΑΝΤΑΓΩΝΙΣΤΙΚΟΤΗΤΑ, ΕΠΙΧΕΙΡΗΜΑΤΙΚΟΤΗΤΑ ΚΑΙ ΚΑΙΝΟΤΟΜΙΑ (ΕΠΑνΕΚ). «ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΕΣ ΥΠΟΔΟΜEΣ ΚΑΙ ΕΡΓΑ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΩΝ ΚΑΙ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΚΩΝ ΦΟΡΕΩΝ» Φορέας χρηματοδότησης: Γενική Γραμματεία Έρευνας & Τεχνολογίας (ΓΓΕΤ).Προϋπολογισμός έργου: 3.000.000,00 €.  (11/2020 – 5/2023).
  2. Επιστημονική συν-υπεύθυνη του έργου με τίτλο “Mapping the interaction profile of microtubule associated proteins (MAPs) in time and space, during out of control cell division in cancer –“2MAP cancer”. Φορέας χρηματοδότησης: Fondation Cancer, Luxembourg (FC/2017/05/2MAP), (2018-2021). Προϋπολογισμός έργου: 533.868,00€.
  3. Επιστημονική Υπεύθυνη του φορέα ΔΠΘ για το έργο BIOIMAGING-GR, με τίτλο «Ελληνική Ερευνητική Υποδομή για την Aπεικόνιση και Παρακολούθηση Θεμελιωδών Διεργασιών στη Βιολογία και την Ιατρική BIOMAGING-GR-DUTH» (MIS5002755). Δράση: ΕΝΙΣΧΥΣΗ ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΩΝ ΥΠΟΔΟΜΩΝ ΕΘΝΙΚΗΣ ΕΜΒΕΛΕΙΑΣ. Φορέας χρηματοδότησης: Γενική Γραμματεία Έρευνας & Τεχνολογίας (ΓΓΕΤ). Προϋπολογισμός έργου: 4.000.000€. (Δεκέμβριος 2017-Ιανουάριος 2021). Συντονιστής: N. Ταβερναράκης. Προϋπολογισμός για το ΔΠΘ 330.000,00€.
  4. Επιστημονική Υπεύθυνη του έργου με τίτλο “ A journey of chromatin remodeling factors fromchromatin to spindle and back: regulation and function, ReLoad”. Φορέας χρηματοδότησης: University of Luxembourg, Internal Research Project, (2014-2017). Προϋπολογισμός έργου: 249.530,00€.
  5. Επιστημονική Υπεύθυνη του έργου με τίτλο “Investigation of the regulatory pathways that govern fidelity of cell division and tumorigenesis through aneuploidy, FidelCheck”. Φορέας χρηματοδότησης: Fonds National de la Recherche Luxembourg, Core 2013, (2014-2017). Προϋπολογισμός έργου: 597.000,00€.
  6. Επιστημονική Υπεύθυνη του φορέα: Εργαστήριο Μοριακής Βιολογίας Κυττάρου, Κυτταρικού κύκλου και Πρωτεομικής (TMBΓ, ΔΠΘ) στο έργο ‘Fluorescent proteins, stable cell lines and lentiviral systems for biomedical studies’ στα πλαίσια του ERA.Net RUS, Linking Russia to the ERA, Pilot Joint Call in Innovation. (2012 – 2014). Προϋπολογισμός 120.000,00€.
  7. Επιστημονική Υπεύθυνη του έργου με τίτλο «Cross border epidemiology of sexually transmitted viralinfections in the female populations: molecular diagnostic approaches”. European Territorial CooperationProgramme Greece – Bulgaria 2007 – 2013. (2012-2014). Προϋπολογισμός 715.350,35 €.
  8. Επιστημονική Υπεύθυνη του φορέα: Εργαστήριο Μοριακής Βιολογίας Κυττάρου, Κυτταρικού κύκλου και Πρωτεομικής (TMBΓ, ΔΠΘ) στο έργο “Ανάπτυξη Καινοτόμων Νανοφορέων ΙΞΑΜΠΕΠΙΛΟΝΗΣ και Μελέτη της Δυνατότητας Εφαρμογής τους στην Αντιμετώπιση του Καρκίνου του Μαστού”, Δράση Συνεργασία, Υπουργείο Παιδείας, Δια Βίου μάθησης και Θρησκευμάτων, EΣΠA 2007-2013. (2011-2014). Η πρόταση εγκρίθηκε με συνολικό προϋπολογισμό 1.000.000 ευρώ. Προϋπολογισμός Φορέα:150.000 €.
  9. Επιστημονική υπεύθυνος (Work Package leader) του υποέργου Development and operation of CIBIT του έργου Strengthening RegionalBioresearch Potential in Greece: Advanced scientific performance at the Department of Molecular Biologyand Genetics in Thrace (Biostrength), της Ευρωπαϊκής Ένωσης. FP7-2008-1. (2009-2012). Grand Agreement No.: 229971. Φορέας Χρηματοδότησης: Ευρωπαϊκή Ένωση. Επ. Υπεύθυνος: Π. Αγανιάν. 2009- 2012. Η πρόταση εγκρίθηκε με συνολικό προϋπολογισμό 1.000.000 €.

  • Tsilingiris D, Natsi AM, Gavriilidis E, Antoniadou C, Eleftheriadou I, Anastasiou IA, Tentolouris A, Papadimitriou E, Eftalitsidis E, Kolovos P, Tsironidou V, Giatromanolaki A, Koffa M, Tentolouris N, Skendros P, Ritis K. Interleukin-8/Matrix Metalloproteinase-9 Axis Impairs Wound Healing in Type 2 Diabetes through Neutrophil Extracellular Traps-Fibroblast Crosstalk. Eur J Immunol. 2025 Apr;55(4):e202451664. doi: 10.1002/eji.202451664. PMID: 40170410; PMCID: PMC11962236.
  • Gavriilidis E, Divolis G, Natsi AM, Kafalis N, Kogias D, Antoniadou C, Synolaki E, Pavlos E, Koutsi MA, Didaskalou S, Papadimitriou E, Tsironidou V, Gavriil A, Papadopoulos V, Agelopoulos M, Tsilingiris D, Koffa M, Giatromanolaki A, Kouklakis G, Ritis K, Skendros P. Neutrophil-fibroblast crosstalk drives immunofibrosis in Crohn’s disease through IFNα pathway. Front Immunol. 2024 Sep 13;15:1447608. doi: 10.3389/fimmu.2024.1447608. PMID: 39346917; PMCID: PMC11427415.
  • Mitrakas A, Stathopoulou MK, Mikra C, Konstantinou C, Rizos S, Malichetoudi S, Koumbis AE, Koffa M, Fylaktakidou KC. Synthesis of 2-Amino-N’-aroyl(het)arylhydrazides, DNA Photocleavage, Molecular Docking and Cytotoxicity Studies against Melanoma CarB Cell Lines. Molecules. 2024 Jan 30;29(3):647. doi: 10.3390/molecules29030647. PMID: 38338390; PMCID: PMC10856246.
  • Didaskalou S, Efstathiou C, Galtsidis S, Kesisova I, Halavatyi A, Elmali T, Tsolou A, Girod A, Koffa M. HURP localization in metaphase is the result of a multi-step process requiring its phosphorylation at Ser627 residue. Front Cell Dev Biol. 2023 Jul 5;11:981425. doi: 10.3389/fcell.2023.981425. PMID: 37484914; PMCID: PMC10361663.
  • Mitrakas AG, Tsolou A, Didaskalou S, Karkaletsou L, Efstathiou C, Eftalitsidis E, Marmanis K, Koffa M. Applications and Advances of Multicellular Tumor Spheroids: Challenges in Their Development and Analysis. Int J Mol Sci. 2023 Apr 8;24(8):6949. doi: 10.3390/ijms24086949. PMID: 37108113; PMCID: PMC10138394.
  • Chrysanthopoulou A, Antoniadou C, Natsi AM, Gavriilidis E, Papadopoulos V, Xingi E, Didaskalou S, Mikroulis D, Tsironidou V, Kambas K, Koffa M, Skendros P, Ritis K. Down-regulation of KLF2 in lung fibroblasts is linked with COVID-19 immunofibrosis and restored by combined inhibition of NETs, JAK-1/2 and IL-6 signaling. Clin Immunol. 2023 Feb;247:109240. doi: 10.1016/j.clim.2023.109240. Epub 2023 Jan 21. PMID: 36693535; PMCID: PMC9862710.
  • Papaioannou, L., Kolokithas-Ntoukas, A., Karkaletsou, L., … Koffa, M.D., Avgoustakis, K. NIR-responsive, lapatinib-loaded gold nanorods for combined photothermal and pharmacological treatment of HER2 positive breast cancer: In vitro evaluation and cell studies. Journal of Drug Delivery Science and Technology, 2023, 82, 104347
  • Tsolou A., Aggelou E., Didaskalou S., Bikiaris D., Avgoustakis K., Agianian M., Koffa M. Folate and pegylated aliphatic polyester nanoparticles for targeted anticancer drug delivery. International Journal of Nanomedicine15:4899-4918, 2020.

Ονοματεπώνυμο Τίτλος Επιβλέποντας Έτος Κατάσταση
Κώστας Νάκος Study of the structure and function of HURP protein in mitotic division Μαρία Κόφφα 2012 Ολοκληρωμένη
Ιλόνα Κεσίσοβα Molecular analysis of HURP protein role in oncogenesis Μαρία Κόφφα 2013 Ολοκληρωμένη
Σωτήρης Γαλτσίδης Functional discrimination of TAp73 isoforms in oncogenesis Μαρία Κόφφα 2016 Ολοκληρωμένη
Raphaella Vacarolli The Nuclear Function of Tes, as an Actin-Binding LIM Protein and a Potential Tumor Suppressor Μαρία Κόφφα 2017 Ολοκληρωμένη
Στέλιος Διδασκάλου Studying the dynamics of Microtubule Associated Proteins (MAPs) during cell division Μαρία Κόφφα 2024 Ολοκληρωμένη

Ονοματεπώνυμο Ιδιότητα
Χρήστος Ευσταθίου Υποψήφιος Διδάκτορας
Ευγένιος Ευταλιτσίδης Υποψήφιος Διδάκτορας
Λητώ Καρκαλέτσου Υποψήφια Διδάκτορας
Κωσταντίνος Μαρμάνης Υποψήφιος Διδάκτορας
Στέλλα Μαλιχετούδη Μεταπτυχιακή Φοιτήτρια
Αναστασία Φάκου Προπτυχιακή Φοιτήτρια

No data found.

Πληροφορίες

Διευθύντρια

Κόφφα Μαρία, Καθηγήτρια

https://bioimaging.mbg.duth.gr

+30 25510 30675

mkoffa@mbg.duth.gr

Τμήμα Μοριακής Βιολογίας & Γενετικής, Δημοκρίτειο Πανεπιστήμιο Θράκης, Δραγάνα, Αλεξανδρούπολη