Σύντομη περιγραφή

Το Εργαστήριο Γονιδιακής Έκφρασης, Μοριακής Διάγνωσης και Σύγχρονων Θεραπευτικών Μέσων του τμήματος Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής, των Σχολών Υγείας του ΔΠΘ ιδρύθηκε το 2002 με στόχο την αριστεία στην εκπαίδευση προπτυχιακών και μεταπτυχιακών φοιτητών στους επιμέρους κλάδους της μοριακής βιολογίας και γενετικής και τη πραγματοποίηση υψηλού επιπέδου βιοϊατρικής έρευνας. Το πεδίο της Γονιδιακής Έκφρασης, Μοριακής Διάγνωσης και των Σύγχρονων Θεραπευτικών Μέσων έχει γνωρίσει συναρπαστικές αλλαγές και αλματώδη πρόοδο στη διάρκεια των τελευταίων χρόνων. Η πρόοδος αυτή, σε συνδυασμό με την ταχύτατη ανάπτυξη νέων τεχνολογιών μελέτης του γονιδιώματος, μεταμορφώνει την Μοριακή Βιολογία και τις εφαρμογές της προς όφελος του ανθρώπου.

  • Μελέτη της γονιδιακής έκφρασης από τη μεταγραφή εώς την έκκριση βιοπολυμερών σε εξωκυττάρια κυστίδια  με στόχο την ανακάλυψη βιοδεικτών και την αξιοποίησή τους ως μοριακούς διαγνωστικούς δείκτες ή θεραπευτικούς στόχους.
  • Εφαρμογή τεχνολογίας ανασυνδυασμένου DNA για την παραγωγή συνθετικών πολυπεπτιδίων.
  • Μελέτη κυτταρικών και μοριακών μηχανισμών, καθώς και μηχανισμών απόκρισης σε ενδογενές ή εξωγενές στρες σε φυσιολογικές και παθολογικές καταστάσεις χρόνιου στρες, όπως ο καρκίνος.
  • Μελέτη της σχέσης μοριακής δομής και λειτουργίας, καθώς και στην απομόνωση φυσικών πρωτεϊνών υψηλής προστιθέμενης αξίας με σημαντικές βιοτεχνολογικές εφαρμογές, κυρίως στην υγεία και τη διατροφή.
  • Μελέτη μοριακών και κυτταρικών μηχανισμών δράσης μικροοργανισμών και στην αξιοποίησή τους για την ανάπτυξη καινοτόμων εφαρμογών Μοριακής Διάγνωσης και Βιοτεχνολογίας.

  • Ταυτοποίηση και επικαιροποίηση βιοδεικτών για την αξιοποίησή τους ως μοριακούς διαγνωστικούς δείκτες ή ως θεραπευτικούς στόχους.
  • Απομόνωση φυσικών πρωτεϊνών υψηλής προστιθέμενης αξίας με σημαντικές βιοτεχνολογικές εφαρμογές.
  • Η εφαρμογή των μεθόδων της Μοριακής Βιολογίας στην Αγροβιολογία με σκοπό τον προσδιορισμό τρόπων αύξησης των αποδόσεων των καλλιεργειών
  • Η απομόνωση, καθαρισμός, και πλήρης χαρακτηρισμός των εξωκυττάριων κυστιδίων απο βιολογικά υγρά (ανθρωπινα, ζωικά και φυτικά) για την ανακάλυψη εξωκυττάριων βιοδεικτών εξέλιξης παθολογικών καταστάσεων και τη μελέτη της βιοδραστικοτητάς τους ως θεραπευτική επιλογή.

  • 82318: ΕΛΕΓΧΟΣ ΑΥΘΕΝΤΙΚΟΤΗΤΑΣ ΚΑΙ ΝΟΘΕΙΑΣ ΑΛΙΕΥΜΑΤΩΝ ΤΗΣ ΕΛΛΗΝΙΚΗΣ ΑΓΟΡΑΣ ΜΕ ΜΟΡΙΑΚΗ ΤΑΥΤΟΠΟΙΗΣΗ (MIS 5033599), Επιχειρησιακό Πρόγραμμα «ΑΛΙΕΙΑΣ ΚΑΙ ΘΑΛΑΣΣΑΣ 2014-2020»,Επιστημονικά Υπεύθυνος Ραφαήλ Σανδαλτζόπουλος. 06/2019-06/2023, Προϋπολογισμός Εργαστηρίου: 109.904,46 €
  • 82528: ΒΕΛΤΙΩΜΕΝΑ ΓΕΝΟΣΗΜΑ ΠΟΛΥΠΕΠΤΙΔΙΚΑ ΦΑΡΜΑΚΑ ΜΕ ΚΑΙΝΟΤΟΜΕΣ ΦΑΡΜΑΚΟΤΕΧΝΙΚΕΣ ΜΟΡΦΕΣ (MIS 5067545) Τ2ΕΔΚ-00996. Επιστημονικά Υπεύθυνος Ραφαήλ Σανδαλτζόπουλος. 07/2020-08/2023, Προϋπολογισμός Εργαστηρίου: 492.006,55 €.
  • 83070: ΕΦΑΡΜΟΓΗ ΤΗΣ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΑΣ eDNA ΓΙΑ ΤΗΝ ΠΑΡΑΚΟΛΟΥΘΗΣΗ ΤΩΝ ΙΧΘΥΟΑΠΟΘΕΜΑΤΩΝ ΚΑΙ ΤΩΝ ΓΕΝΕΤΙΚΩΝ ΠΟΡΩΝ ΤΟΥ ΥΔΑΤΙΝΟΥ ΠΕΡΙΒΑΛΛΟΝΤΟΣ ΤΟΥ ΘΡΑΚΙΚΟΥ ΠΕΛΑΓΟΥΣ ΩΣ ΕΡΓΑΛΕΙΟ ΑΕΙΦΟΡΙΚΗΣ ΔΙΑΧΕΙΡΙΣΗΣ (ECOeDNA) Μέλος Ερευνητικής ομάδας. 06/2023-05/2025. Προϋπολογισμός: 200.000€.
  • 82733: BioActiveScreen HFRI-FM17C3-2007 ΕΡΕΥΝΗΤΙΚΗ ΥΠΟΔΟΜΗ BIOACTIVESCREEN ΣΤΗ ΒΟΡΕΙΑ ΕΛΛΑΔΑ: ΤΑΥΤΟΠΟΙΗΣΗ ΒΙΟΕΝΕΡΓΩΝ ΦΥΤΟΧΗΜΙΚΩΝ ΟΥΣΙΩΝ ΥΨΗΛΗΣ ΠΡΟΣΤΙΘΕΜΕΝΗΣ ΑΞΙΑΣ ΑΠΟ ΕΝΔΗΜΙΚΑ ΑΡΩΜΑΤΙΚΑ ΦΥΤΑ (2007). Μέλος ερευνητικής ομάδας ΔΠΘ, 2021-2025. Προϋπολογισμός έργου: 1.440.000€.
  • 82584: MilkSafe  ΧΡΉΣΗ ΟΜΙΚΏΝ ΤΕΧΝΟΛΟΓΙΏΝ ΓΙΑ ΤΟΝ ΜΟΡΙΑΚΌ ΧΑΡΑΚΤΗΡΙΣΜΌ ΚΑΙ ΕΜΠΛΟΥΤΙΣΜΌ ΤΟΥ ΜΗΤΡΙΚΟΎ ΓΆΛΑΚΤΟΣ ΓΙΑ ΤΑ ΝΕΟΓΝΆ». Επιστημονικά Υπεύθυνος της ερευνητικής ομάδας ΔΠΘ Αντώνης Γιαννακάκης (2020-2023)  Συνολική χρηματοδότηση: 999,545 €, Προυπολογισμός για το ΔΠΘ: 136,050 €.

  1. Gouzouasis, V., Sarrigeorgiou, I., Tsifintaris, M., Markoglou, N., Georgopoulou, U., Lymberi, P., Anagnostouli, M., Probert, L. and Giannakakis, A (2025). Double-stranded RNA Antiviral Signature in Early Multiple Sclerosis. Frontiers in Microbiology – Virology IF: 4.5
  2. Tsifintaris, M., Grigoriadis, D., Sitmalidis, M., Repanas, P. Lazarashvili, E., Anastasiadi, C., Kavakiotis, I., Sandaltzopoulos, R., Pavlopoulos G.A., and Giannakakis, A (2025). ASTRA: A Comprehensive Resource of Stress-induced Transcriptional Activity in Human Cell Lines. Νucleic Acid Research, Database issue, https://doi.org/10.1093/nar/gkaf1174 IF: 13.1
  3. Tsifintaris, M., Sitmalidis, M., Tokamani, M., … Sandaltzopoulos, R., Giannakakis, A. 2024. Analysis of Human Milk Microbiota in Northern Greece by Comparative 16S rRNA Sequencing vs. Local Dairy Animals. Nutrients, 2024, 16(14), 2175
  4. Giannakakis, Α., Tsifintaris, Μ., Gouzouasis, V., Ow, G. S., Aau, M. Y., Papp, C. Ivshina, , A. V., and Kuznetsov, V. A. 2024. KDM7A-DT induces genotoxic stress, tumorigenesis, and progression of p53 missense mutation-associated invasive breast cancer. Frontiers in Oncology, vol. 14, pp. 1227151.
  5. Stefanidis, E., Semilietof, A., Pujol, J., … Coukos, G., Irving, M. 2023. Combining SiRPα decoy–coengineered T cells and antibodies augments macrophage-mediated phagocytosis of tumor cells. Journal of Clinical Investigation, 134(11),e161660.
  6. Varsamis, G.D., Karafyllidis, I.G., Gilkes, K.M., … Jessen, H.C., Wong, J. 2023. Quantum gate algorithm for reference-guided DNA sequence alignment. Computational Biology and Chemistry, 107, 107959.
  7. Varsamis, G.D., Karafyllidis, I.G., Gilkes, K.M., … Kolovos, P., Sandaltzopoulos, R. 2023. Quantum algorithm for de novo DNA sequence assembly based on quantum walks on graphs. BioSystems, 233, 105037.
  8. Chronopoulou, S., Tsochantaridis, I., Tokamani, M., … Pappa, A., Sandaltzopoulos, R. 2023. Expression and purification of human interferon alpha 2a (IFNα2a) in the methylotrophic yeast Pichia pastoris. Protein Expression and Purification, 211, 106339.
  9. Tokamani, M., Figgou, E., Papamichail, L., … Matthaiou, E.I., Sandaltzopoulos, R. 2023. A Multiplex PCR Melting-Curve-Analysis-Based Detection Method for the Discrimination of Five Aspergillus Species. Journal of Fungi, 9(8), 842.Chatzoglou, E., Tsaousi, N., Apostolidis, A.P., … Triantaphyllidis, G., Miliou, H. 2023. High-Resolution Melting (HRM) Analysis for Rapid Molecular Identification of Sparidae Species in the Greek Fish Market. Genes, 14(6), 1255.
  10. Giantsis, I.A., Tokamani, M., Triantaphyllidis, G., … Sandaltzopoulos, R., Apostolidis, A.P. 2023. Development of Multiplex PCR and Melt–Curve Analysis for the Molecular Identification of Four Species of the Mullidae Family, Available in the Market. Genes, 14(5), 96
  11. Mourtzi N., Siahanidou, T., Tsifintaris, M., Karamichali, E., Tasiopoulou, A., Sertedaki, , A., Pesmatzoglou, M., Kapetanaki, A., Liosis, G., Baltatzis, G., Vlachakis, D., Chrousos, G., and Giannakakis, A. 2021. LncRNA NORAD is consistently detected in breastmilk exosomes and downregulated in mothers of preterm infants. Int J Mol Med 48: 216.

Ονοματεπώνυμο Τίτλος Επιβλέποντας Έτος Κατάσταση
Σεμιλιέτωφ Κατερίνα Ανάπτυξη και αξιολόγηση συστήματος ανθρωποποιημένων ποντικών ως προκλινικό μοντέλο καινοτόμων αντικαρκινικών ανοσοθεραπειών Ραφαήλ Σανδαλτζόπουλος 2019 Ολοκληρωμένο
Τοκαμάνη Μαρία Μελέτη miRNA που εμπλέκονται σε σηματοδοτικά μονοπάτια στον καρκίνο του πνεύμονα Ραφαήλ Σανδαλτζόπουλος 2018 Ολοκληρωμένο
Ματθαίου Ευθυμία-Ηλιάνα Νανοθεραπευτικές προσεγγίσεις σε επιθηλιακούς καρκίνους Ραφαήλ Σανδαλτζόπουλος 2017 Ολοκληρωμένο
Καραπέτσας Θανάσης Μελέτη μοριακών δεικτών στον καρκίνο των ωοθηκών Ραφαήλ Σανδαλτζόπουλος 2014 Ολοκληρωμένο
Ευρυπίδης Λανίτης Ανάπτυξη και αξιολόγηση πειραματικού συστήματος κυτταρικής ανοσοθεραπείας του καρκίνου των ωοθηκών Ραφαήλ Σανδαλτζόπουλος 2013 Ολοκληρωμένο
Ντενάρντα Ντανγκαη Ο ρόλος των μεμβρανικών γλυκοπρωτεϊνών στον καρκίνο των ωοθηκών Ραφαήλ Σανδαλτζόπουλος 2013 Ολοκληρωμένο
Ευρυπίδης Λανίτης Ανάπτυξη και αξιολόγηση πειραματικού συθστήματος κυτταριθκής ανοσοθεραπείας του καρκίνου των ωοθηκών Ραφαήλ Σανδαλτζόπουλος 2007 Ολοκληρωμένο
Μαργαρίτης Τσιφιντάρης Υψηλής-Απόδοσης Υπολογιστική Ανάλυση Μη- κωδικοποιών μηχανισμών και Επιγενετικών Δεικτών στην Παθοφυσιολογία του Σ Αντώνης Γιαννακάκης 2024 Ολοκληρωμένο
Βασίλειος Γουζούασης Γονιδιωματική χαρτογράφηση ενδοκυττάριων και εξωκυττάριων μη-κωδικοποιών RNAs από βιολογικά υγρά ασθενών με Σκλήρυνση κατά Πλάκας και συσχέτισή τους με μονοπάτια του στρες Αντώνης Γιαννακάκης 2025 Ολοκληρωμένο

Ονοματεπώνυμο Ιδιότητα
Αντώνης Γιαννακάκης [get_post_data title="Γιαννακάκης Αντώνης" field="meta" key="job_title"]
Αριστέα Μαρίνα Ζήγκου Υποψήφια Διδάκτωρ
Χριστίνα Αναστασιάδη Υποψήφια Διδάκτωρ

Ονοματεπώνυμο Ιδιότητα
Μαρία Τοκαμάνη Μεταδιδακτορική Ερευνήτρια

Πληροφορίες

Διευθυντής

Σανδαλτζόπουλος Ραφαήλ, Καθηγητής

https://theranostics.edu.gr/

+30 25510 30623

rms.lab.duth@gmail.com

Τμήμα Μοριακής Βιολογίας και Γενετικής, κτήριο «Φώτης Καφάτος», 1ος όροφος, Δραγάνα, Δ.Π.Θ. Αλεξανδρούπολη, 68100