Εργαστήριο Βιοχημείας και Μοριακής Ιολογίας

Σύντομη περιγραφή

To εργαστήριο Βιοχημείας και Μοριακής Ιολογίας θεσμοθετήθηκε το 2015 (ΦΕΚ 1673/11-08-2015 τ.β.) και εξυπηρετεί τις εκπαιδευτικές, ερευνητικές και αναπτυξιακές ανάγκες του Τμήματος στο γνωστικό αντικείμενο της Βιοχημείας, και αποτελεί φορέα εκπόνησης ερευνητικών προγραμμάτων σε θέματα που εμπίπτουν στα αντικείμενα δραστηριότητας του εργαστηρίου καθώς και στην παροχή εξειδικευμένων υπηρεσιών στα πλαίσια τόσο συνεργασιών όσο και των εθνικών ερευνητικών υποδομών.

Ερευνητικά Ενδιαφέροντα

Η ερευνητική δραστηριότητα του εργαστηρίου τα τελευταία χρόνια εστιάζεται στις ακόλουθες θεματικές ενότητες:

Κ. Κατσάνη:

Μελέτη των μηχανισμών με τους οποίους οι πρωτεΐνες των πυρηνικών πόρων επηρεάζουν την ανθρώπινη φυσιολογία με έμφαση στο σύνδρομο Triple A και την ιϊκή προσβολή.
Μελέτη της αρχιτεκτονικής του πυρήνα και των πρωτεϊνών των πυρηνικών πόρων του οργανισμού μοντέλου D. Melanogaster
Eκφραση πρωτεϊνών σε ευκαρυωτικά συστήματα για δομικές μελέτες (πρωτεϊνες πυρηνικών πόρων) ή/και ανοσολογικές μελέτες (ιϊκές πρωτεϊνες)
Μελέτες φωτοδιάσπασης βιομορίων.

Π. Χανδρής:

Μελέτη της δυναμικής του μεταβολισμού – Αμφιεπικοινωνία μιτοχονδρίων-πυρήνα
Συστήματα μελέτης της δυναμικής και του μεταβολισμού του RNA σε ζωντανά κύτταρα σε πραγματικό χρόνο.
Επίδραση του μεταβολισμού λιπιδίων στα υποκυτταρικά οργανίδια.
Προηγμένα συστήματα μικροσκοπίας και χρήση/ανάπτυξη γενετικά κωδικοποιημένων ιχνηθετών για τη μελέτη μοριακών αλληλεπιδράσεων και μεταβολιτών σε ζωντανά κύτταρα.
Ομικές προσεγγίσεις (Πρωτεομική, λιπιδομική, μεταβολομική).

Καινοτόμες Υπηρεσίες

Ερευνητικά Προγράμματα

InTechThrace: Integrated Technologies in biomedical research: multilevel biomarker analysis in Thrace” (MISCode 5047285), Επιχειρησιακό Πρόγραμμα «Ανταγωνιστικότητα, Επιχειρηματικότητα, Καινοτομία» (2021-2023).
“INSPIRED” (The National Research Infrastructures on Integrated Structural Biology, Drug Screening Efforts and Drug target functional characterization) με κωδικό ΟΠΣ (MIS) 500255 (2018 – 2022).

Δημοσιεύσεις

Κ. Κατσάνη:

Soultas, Stefanos, Meliopoulos Konstantinos, Psomas, George, Katsani Katerina & Fylaktakidou, Konstantina## (2025). Oxime esters on 4-nitrobenzaldehyde and 9,10-anthraquinone-2-carboxaldehyde templates: DNA- and albumin-binding and photocleavage studies. Arkivoc.10.24820/ark.5550190.p012.348.
Ioannides AN, Katsani KR, Ouzounis CA, Promponas VJ. A library of sensitive position-specific scoring matrices for high-throughput identification of nuclear pore complex subunits. NAR Genom Bioinform. 2023 Mar 23;5(1):lqad025. doi: 10.1093/nargab/lqad025. PMID: 36968432; PMCID: PMC10034585.
Vrazas V, Moustafa S, Makridakis M, Karakasiliotis I, Vlahou A, Mavromara P, Katsani KR. A Proteomic Approach to Study the Biological Role of Hepatitis C Virus Protein Core+1/ARFP. Viruses. 2022 Jul 31;14(8):1694. doi: 10.3390/v14081694. PMID: 36016316
Katsani KR, Sakellari D Saliva proteomics updates in biomedicine. J Biol Res (Thessalon). 2019 Dec 12;26:17. doi: 10.1186/s40709-019-0109-7. eCollection 2019 Dec. PMID: 31890650 (review)

Π. Χανδρής:

Martina Samiotaki, George Panayotou, Chandris P*. Detection of Protein Tyrosine Phosphatase Interacting Partners by Mass Spectrometry (*Corresponding author). Methods Mol Biol 2024:2743:165-180.
Kenworthy C., Liou SH, Chandris P., Wong V., Dziuba P., Liu Wei-Li, Lavis LD, Singer RH, and Coleman RA. “Bromodomains regulate dynamic targeting of the PBAF chromatin-remodeling complex to chromatin hubs” Biophysical Journal, 2022 May 3; 121(9):1738-1752). (Also: bioRxiv 111674; doi: https://doi.org/10.1101/111674).
Chandris P.*, Giannouli CC. Panayotou G. “Imaging approaches for the study of metabolism in real time using genetically encoded reporters” Front Cell Dev Biol. 2022 Jan 18;9:725114. doi: 10.3389/fcell.2021.725114. eCollection 2021 (* Corresponding author).
Guo M., Chandris P., Giannini JP, Trexler AJ, Fischer R., Chen J., Vishwasrao H., Rey-Suarez I., Wu Y., Waterman C., Patterson GH, Upadhyaya A., Taraska J., Shroff H. “Single shot super-resolved total internal reflection fluorescence microscopy” Nature Methods. 2018 Jun;15(6):425-428 [Epub ahead of print]